Ao longo destes anos, o PPGEISU tem recebido bolsas de estudos para os estudantes, das seguintes instituições: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) e Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia (FAPESB). Em 2021, o programa conta com 5 bolsas da CAPES e 4 bolsas da FAPESB. Essas bolsas são distribuídas conforme a legislação nacional e a Resolução de Bolsas do Programa, que contempla o programa de cotas e a vulnerabilidade socioeconômica. Há também bolsas de iniciação científica, através das quais alunos da graduação se vinculam a projetos de pesquisa desenvolvidos pelos professores permanentes. Essas bolsas são financiadas pelo CNPq, FAPESB e UFBA. Além disso, a Pró-Reitoria de Assistência Estudantil da UFBA (PROAE) oferece recursos para a permanência, na universidade, de estudantes de graduação e pós graduação em situação de vulnerabilidade socioeconômica, através do acesso à residência e restaurantes universitários, creche, auxílio transporte, auxílio moradia e bolsas de apoio. Para tanto, é necessário fazer um cadastro através do site www.proae.ufba.br.
Alguns docentes permanentes do Programa recebem bolsa de Produtividade em Pesquisa pelo CNPq, através de edital. Alguns dos projetos de pesquisa dos docentes são financiados por diferentes agências de fomento, também através de editais. O PPGEISU tem contado com Bolsas de Pós-doutorado no Brasil e no Exterior para a qualificação de seu corpo docente.
O PPGEISU recebe, anualmente, recursos do Programa de Apoio à Pós-graduação (PROAP), da CAPES, que financia a participação de docentes e discentes em eventos nacionais e internacionais, bem como publicações, através de auxílio financeiro. Apoio financeiro para tradução e revisão de artigos é dado pela própria UFBA, através de edital próprio. Esses apoios também são ofertados por agências de fomento à participação em eventos e publicação, a exemplo do CNPq e FAPESB, mediante editais. Informações sobre editais de financiamento podem ser acessadas através dos sites www.capes.gov.br, www.
